从2002年开始，水利部太湖流域管理局就组织流域内苏浙沪二省一市开始太湖流域水资源综合规划，历时6年，现已编制完成。水利部太湖流域管理局副局长叶寿仁说，这个规划年内将由水利部报国务院审批。规划一经批准，将成为流域内水资源开发利用和治理保护的基本依据。
据介绍，太湖流域水资源综合规划的基准年是2004年。当年，太湖流域236亿立方米供水量中，有62亿立方米原水水质不合格，不合格率高达35.8%。近年来，太湖蓝藻暴发更为水资源危机拉响了“警报”。本次规划突出强调了提高城镇污水处理率，2010年要达到75%至80%，2020年要达到85%至90%，2030年要达到90%至95%。同时要不断提高污水处理标准，这样可以有效削减主要污染物排放量，到2020年基本解决太湖流域水质型缺水问题。
叶寿仁说，太湖治污的另一个关键是要调整产业结构、调整产业布局。要根据太湖流域人口密度大、产业密度高，水资源、水环境承载能力低的特点，大力调整产业结构和调整产业布局。严禁发展高耗水、高污染产业。本次规划提出，今后，流域内原则上不再新建火电站，对于现有的直流冷却火电站，也要限期进行循环冷却技术改造。
在规划中，太湖流域城市万元GDP用水量成了一项重要标准。到2030年，通过强化节水，流域万元GDP用水量要由基准年的208立方米降为35立方米，万元工业增加值用水量由基准年的200立方米降为43立方米。经测算，达标后常水年可节水38.4亿立方米，中等干旱年可节水41亿立方米。由于节约用水，城镇生活、一般工业、三产和建筑业可减排污水12.6亿立方米。
为解决太湖流域水资源不足和水环境恶化等问题，长三角将长期开展“引江济太”工程。除现有的引江河道外，计划投资120亿元新辟沟通长江和太湖的新孟河工程，并扩大已有的望虞河工程。计划到2030年可增加引长江水量常水年46.6亿立方米、枯水年55亿立方米。
太湖涉及苏浙沪两省一市，涉及水利、环保、建设、交通、农业、渔业、旅游等多行业，制订一部专门的法规来规范太湖管理已刻不容缓。叶寿仁说，通过立法来管理太湖，规范各行各业、各地各方涉水事务，明确管理关系和管理责任，意义重大。
根据规划，未来的太湖管理必须按规定开展。例如，按批准的防洪调度方案进行防洪调度，按批准的太湖水量分配方案进行太湖水资源调度，按允许排污总量控制重点污染物入湖量，按批准的太湖岸线利用规划规范沿湖建设项目，按批准的养殖面积和范围进行渔业开发。
